Дом-музей В. И. Ленина был открыт 21 января 1941 года. В мае 1924 года было принято постановление увековечить места, связанные с В. И. Лениным. Как и по всей стране, в Уфе начался поиск дома, где, отбывая ссылку, жила Н. К. Крупская, где 3 недели жил В. И. Ленин и провел ряд важных встреч с уфимскими социал-демократами летом 1900 года. Дом не раз подвергался реконструкции. Был несколько видоизменен фасад здания, но оно стоит в том же месте, на том же фундаменте, хотя и несколько в обновленном облике.

Дом, в котором жил В. И. Ленин и Н. К. Крупская в 1900 году, является объектом культурного наследия федерального значения. Обстановка восстановлена по воспоминаниям Н. К. Крупской. В фондах музея имеются ценные подлинные экспонаты (личные вещи Надежды Константиновны). Дорогим экспонатом в музее являются часы-ходики, принадлежавшие Н. К. Крупской. Она передала их в 1938 году через А. И. Крылова. Также посетители могут увидеть предметы интерьера и быта рубежа ХIХ–ХХ вв.

Основная экспозиция музея посвящена пребыванию В. И. Ленина и Н. К. Крупской в Уфе в 1900 году. Фонды музея ежегодно пополняются, на сегодняшний день в фондах числится более 7 тыс. экспонатов. Со дня открытия Дом-музей В. И. Ленина посетило около 5 млн человек из более чем 100 стран.